Distintas irregularidades detectadas en las listas de espera fueron el motivo para que la Contraloría General de la República realizara una auditoría a cuatro hospitales: Ovalle en Coquimbo; Osorno en Los Lagos; Angol en La Araucanía y Talca en El Maule.
Se detectó que en todos los establecimientos se realizaron intervenciones quirúrgicas a funcionarios o familiares de estos, con tiempos de espera inferiores al promedio de otros pacientes de la lista de espera No GES.
En el caso del Hospital de Ovalle, fueron 16 casos de intervenciones quirúrgicas realizadas a un funcionario o familiar de este en las mismas fechas, por consiguiente, suspendiendo cirugías a otros pacientes de la lista de espera. Por este motivo la Contraloría Regional de Coquimbo ordenó un sumario interno para determinar las responsabilidades administrativas.